• 谷物加工与品质调控创新团队
• 植物蛋白结构与功能调控创新团队
• 肉品科学与营养工程创新团队
• 果蔬加工与品质调控创新团队
• 薯类食品科学与技术创新团队
• 中式食品加工与装备创新团队
• 食物营养与功能性食品创新团队
• 食品生物制造创新团队
• 粮油减损与真菌毒素防控创新团队
• 植物化学组分与组学研究创新团队（所级）
• 农产品加工质量安全防控创新团队（所级）
• 农产品保鲜与物流创新团队（所级）
• 乳品加工与品质调控创新团队（所级）
• 马铃薯加工与品质调控创新团队（所级）
• 乡村产业振兴研究中心团队（所级）